Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms