Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prrc2bQ7TPM1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms