Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Raver2Q7TPD6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms