Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms