Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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