Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynmQ70IV5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms