Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27lQ6ZWY3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms