Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Topbp1Q6ZQF0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms