Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms