Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc9c1Q6UJY2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms