Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms