Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx4Q6RUU0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms