Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt9Q6RHW0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt9Q6RHW0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms