Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJN8

Dalrd3, DALR anticodon-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dalrd3Q6PJN8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dalrd3Q6PJN8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dalrd3Q6PJN8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms