Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrn2Q6PHP6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms