Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms