Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms