Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad54bQ6PFE3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms