Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit2Q6PFC5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit2Q6PFC5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms