Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SvoplQ6PDF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvoplQ6PDF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms