Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trak1Q6PD31 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms