Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2aQ6P4T0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2aQ6P4T0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms