Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms