Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frg2f1Q6P3A2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms