Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc4Q6P2L7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc4Q6P2L7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms