Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm2bQ6P1G2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms