Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4Q6P1D7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms