Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxip1Q6NZQ4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms