Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms