Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Soga3Q6NZL0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Soga3Q6NZL0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms