Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms