Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf6Q6NVF9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms