Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms