Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SphkapQ6NSW3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms