Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc66Q6NS45 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms