Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sohlh1Q6IUP1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sohlh1Q6IUP1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sohlh1Q6IUP1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sohlh1Q6IUP1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms