Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep78Q6IRU7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep78Q6IRU7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms