Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CltbQ6IRU5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms