Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms