Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbf1Q6DFZ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbf1Q6DFZ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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