Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nop58Q6DFW4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nop58Q6DFW4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms