Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6DFW0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms