Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170Q6A065 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170Q6A065 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms