Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd6Q69ZL1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms