Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrcc1Q69ZB0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrcc1Q69ZB0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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