Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spty2d1Q68FG3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spty2d1Q68FG3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms