Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3ipQ68EF0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms