Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CilpQ66K08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms