Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VclQ64727 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VclQ64727 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VclQ64727 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VclQ64727 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VclQ64727 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VclQ64727 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VclQ64727 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VclQ64727 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms