Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms